Example usage for javafx.stage FileChooser showOpenDialog

List of usage examples for javafx.stage FileChooser showOpenDialog

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Introduction

In this page you can find the example usage for javafx.stage FileChooser showOpenDialog.

Prototype

public File showOpenDialog(final Window ownerWindow)

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Document

Shows a new file open dialog.

Usage

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

/**
 *
 * @throws IOException/* ww  w.  j a  v a  2 s  .  c om*/
 * @throws InterruptedException
 */
private void projetCharge() throws IOException, InterruptedException {
    paneAttends.setVisible(true);
    while (!paneAttends.isVisible()) {

    }
    if (!repertSauveChoisi) {
        repertoireProjet = currentDir;
    }
    Action reponse = null;
    Localization.setLocale(locale);
    if (!dejaSauve) {
        reponse = Dialogs.create().owner(null).title("Charge un Projet")
                .masthead("Vous n'avez pas sauvegard votre projet").message("Voulez vous le sauver ?")
                .showConfirm();

    }
    if (reponse == Dialog.Actions.YES) {
        try {
            projetSauve();

        } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
    }
    if ((reponse == Dialog.Actions.YES) || (reponse == Dialog.Actions.NO) || (reponse == null)) {
        Thread.sleep(100);
        dejaSauve = true;
        FileChooser repertChoix = new FileChooser();
        FileChooser.ExtensionFilter extFilter = new FileChooser.ExtensionFilter("fichier panoVisu (*.pvu)",
                "*.pvu");
        repertChoix.getExtensionFilters().add(extFilter);
        File repert = new File(repertoireProjet + File.separator);
        repertChoix.setInitialDirectory(repert);
        fichProjet = null;
        fichProjet = repertChoix.showOpenDialog(stPrincipal);
        if (fichProjet != null) {
            stPrincipal.setTitle("Panovisu v" + numVersion + " : " + fichProjet.getAbsolutePath());
            lblDragDrop.setVisible(false);
            repertoireProjet = fichProjet.getParent();
            ajouteFichierHisto(fichProjet.getAbsolutePath());
            repertSauveChoisi = true;
            deleteDirectory(repertTemp);
            String repertPanovisu = repertTemp + File.separator + "panovisu";
            File rptPanovisu = new File(repertPanovisu);
            rptPanovisu.mkdirs();
            copieDirectory(repertAppli + File.separator + "panovisu", repertPanovisu);
            menuPanoramique.setDisable(false);
            imgAjouterPano.setDisable(false);
            imgAjouterPano.setOpacity(1.0);
            imgSauveProjet.setDisable(false);
            imgSauveProjet.setOpacity(1.0);
            imgVisiteGenere.setDisable(false);
            imgVisiteGenere.setOpacity(1.0);

            paneChoixPanoramique.setVisible(false);

            sauveProjet.setDisable(false);
            sauveSousProjet.setDisable(false);
            visiteGenere.setDisable(false);
            numPoints = 0;
            numImages = 0;
            numHTML = 0;
            imagePanoramique.setImage(null);
            listeChoixPanoramique.getItems().clear();
            listeChoixPanoramiqueEntree.getItems().clear();
            FileReader fr;
            try {
                fr = new FileReader(fichProjet);
                String texte;
                try (BufferedReader br = new BufferedReader(fr)) {
                    texte = "";
                    String ligneTexte;
                    while ((ligneTexte = br.readLine()) != null) {
                        texte += ligneTexte + "\n";
                    }
                }
                try {
                    analyseLigne(texte);
                } catch (ImageReadException ex) {
                    Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
                }

                panoActuel = 0;
                affichePanoChoisit(panoActuel);
                panoCharge = true;
                paneChoixPanoramique.setVisible(true);
                listeChoixPanoramique.setValue(listeChoixPanoramique.getItems().get(0));

            } catch (FileNotFoundException ex) {
                Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
            }

        }
    }
    paneAttends.setVisible(false);
}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

private void panoAjouteImage(double X, double Y) {
    if (X > 0 && X < imagePanoramique.getFitWidth()) {

        valideHS();//from w ww .ja v a2  s  . com
        dejaSauve = false;
        stPrincipal.setTitle(stPrincipal.getTitle().replace(" *", "") + " *");
        double mouseX = X;
        double mouseY = Y - pano.getLayoutY() - 115;
        double longitude, latitude;
        double largeur = imagePanoramique.getFitWidth();
        String chLong, chLat;
        longitude = 360.0f * mouseX / largeur - 180;
        latitude = 90.0d - 2.0f * mouseY / largeur * 180.0f;
        Circle point = new Circle(mouseX, mouseY, 5);
        point.setFill(Color.BLUE);
        point.setStroke(Color.YELLOW);
        point.setId("img" + numImages);
        point.setCursor(Cursor.DEFAULT);
        pano.getChildren().add(point);
        Tooltip t = new Tooltip("image n " + (numImages + 1));
        t.setStyle(tooltipStyle);
        Tooltip.install(point, t);

        //
        File repert;
        if (repertHSImages.equals("")) {
            repert = new File(currentDir + File.separator);
        } else {
            repert = new File(repertHSImages);
        }
        FileChooser fileChooser = new FileChooser();
        FileChooser.ExtensionFilter extFilterImages = new FileChooser.ExtensionFilter(
                "Fichiers Images (jpg, bmp, png)", "*.jpg", "*.bmp", "*.png");

        fileChooser.setInitialDirectory(repert);
        fileChooser.getExtensionFilters().addAll(extFilterImages);

        File fichierImage = fileChooser.showOpenDialog(null);
        if (fichierImage != null) {
            repertHSImages = fichierImage.getParent();
            numImages++;
            HotspotImage HS = new HotspotImage();
            HS.setLongitude(longitude);
            HS.setLatitude(latitude);
            HS.setUrlImage(fichierImage.getAbsolutePath());
            HS.setLienImg(fichierImage.getName());
            HS.setInfo(fichierImage.getName().split("\\.")[0]);
            File repertImage = new File(repertTemp + File.separator + "images");
            if (!repertImage.exists()) {
                repertImage.mkdirs();
            }
            try {
                copieFichierRepertoire(fichierImage.getAbsolutePath(), repertImage.getAbsolutePath());
            } catch (IOException ex) {
                Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
            }
            panoramiquesProjet[panoActuel].addHotspotImage(HS);
            retireAffichageHotSpots();
            Pane affHS1 = affichageHS(listePano(panoActuel), panoActuel);
            affHS1.setId("labels");
            outils.getChildren().add(affHS1);

        } else {
            String chPoint = point.getId();
            chPoint = chPoint.substring(3, chPoint.length());
            Node pt = (Node) pano.lookup("#img" + chPoint);
            pano.getChildren().remove(pt);
        }
        valideHS();
        point.setOnDragDetected((MouseEvent me1) -> {
            point.setFill(Color.YELLOW);
            point.setStroke(Color.BLUE);
            dragDrop = true;
            me1.consume();

        });
        point.setOnMouseDragged((MouseEvent me1) -> {
            double XX = me1.getX() - imagePanoramique.getLayoutX();
            if (XX < 0) {
                XX = 0;
            }
            if (XX > imagePanoramique.getFitWidth()) {
                XX = imagePanoramique.getFitWidth();
            }
            point.setCenterX(XX + imagePanoramique.getLayoutX());
            double YY = me1.getY();
            if (YY < 0) {
                YY = 0;
            }
            if (YY > imagePanoramique.getFitHeight()) {
                YY = imagePanoramique.getFitHeight();
            }
            point.setCenterY(YY);

            me1.consume();

        });
        point.setOnMouseReleased((MouseEvent me1) -> {
            String chPoint = point.getId();
            chPoint = chPoint.substring(3, chPoint.length());
            int numeroPoint = Integer.parseInt(chPoint);
            double X1 = me1.getSceneX();
            double Y1 = me1.getSceneY();
            double mouseX1 = X1 - imagePanoramique.getLayoutX();
            if (mouseX1 < 0) {
                mouseX1 = 0;
            }
            if (mouseX1 > imagePanoramique.getFitWidth()) {
                mouseX1 = imagePanoramique.getFitWidth();
            }

            double mouseY1 = Y1 - pano.getLayoutY() - 109;
            if (mouseY1 < 0) {
                mouseY1 = 0;
            }
            if (mouseY1 > imagePanoramique.getFitHeight()) {
                mouseY1 = imagePanoramique.getFitHeight();
            }

            double longit, lat;
            double larg = imagePanoramique.getFitWidth();
            longit = 360.0f * mouseX1 / larg - 180;
            lat = 90.0d - 2.0f * mouseY1 / larg * 180.0f;
            panoramiquesProjet[panoActuel].getHotspotImage(numeroPoint).setLatitude(lat);
            panoramiquesProjet[panoActuel].getHotspotImage(numeroPoint).setLongitude(longit);
            point.setFill(Color.BLUE);
            point.setStroke(Color.YELLOW);
            me1.consume();

        });

        point.setOnMouseClicked((MouseEvent me1) -> {
            if (me1.isControlDown()) {
                dejaSauve = false;
                stPrincipal.setTitle(stPrincipal.getTitle().replace(" *", "") + " *");
                String chPoint = point.getId();
                chPoint = chPoint.substring(3, chPoint.length());
                int numeroPoint = Integer.parseInt(chPoint);
                Node pt;
                pt = (Node) pano.lookup("#img" + chPoint);
                pano.getChildren().remove(pt);

                for (int o = numeroPoint + 1; o < numImages; o++) {
                    pt = (Node) pano.lookup("#img" + Integer.toString(o));
                    pt.setId("img" + Integer.toString(o - 1));
                }
                /**
                 * on retire les anciennes indication de HS
                 */
                retireAffichageHotSpots();
                numImages--;
                panoramiquesProjet[panoActuel].removeHotspotImage(numeroPoint);
                /**
                 * On les cre les nouvelles
                 */
                ajouteAffichageHotspots();
            }
            valideHS();
            me1.consume();
        });

    }
}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

private void planAjouter() {
    FileChooser fileChooser = new FileChooser();

    FileChooser.ExtensionFilter extFilterJpeg = new FileChooser.ExtensionFilter("Fichiers JPEG (*.jpg)",
            "*.jpg");
    FileChooser.ExtensionFilter extFilterBmp = new FileChooser.ExtensionFilter("Fichiers BMP (*.bmp)", "*.bmp");
    FileChooser.ExtensionFilter extFilterPng = new FileChooser.ExtensionFilter("Fichiers PNG (*.png)", "*.png");
    File repert = new File(currentDir + File.separator);
    fileChooser.setInitialDirectory(repert);
    fileChooser.getExtensionFilters().addAll(extFilterJpeg, extFilterPng, extFilterBmp);

    File fichierPlan = fileChooser.showOpenDialog(null);
    if (fichierPlan != null) {
        plans[nombrePlans] = new Plan();
        plans[nombrePlans].setImagePlan(fichierPlan.getName());
        plans[nombrePlans].setLienPlan(fichierPlan.getAbsolutePath());
        File repertoirePlan = new File(repertTemp + File.separator + "images");
        if (!repertoirePlan.exists()) {
            repertoirePlan.mkdirs();/*ww  w .j a  va2 s  .  c o m*/
        }
        try {
            copieFichierRepertoire(fichierPlan.getAbsolutePath(), repertoirePlan.getAbsolutePath());
        } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
        gestionnairePlan.ajouterPlan();
        nombrePlans++;
    }

}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

/**
 *
 * @throws IOException Exception d'entre sortie
 *//* ww  w.j  a  v  a 2 s . c  o  m*/
private static void modeleCharger() throws IOException {
    FileChooser fileRepertChoix = new FileChooser();
    FileChooser.ExtensionFilter extFilter = new FileChooser.ExtensionFilter("fichier panoVisu (*.tpl)",
            "*.tpl");
    fileRepertChoix.getExtensionFilters().add(extFilter);
    File repert = new File(getStrRepertAppli() + File.separator + "templates");
    fileRepertChoix.setInitialDirectory(repert);
    File filetemplate = fileRepertChoix.showOpenDialog(getStPrincipal());
    if (filetemplate != null) {
        try {
            List<String> strListTemplate = new ArrayList<>();
            BufferedReader brTemplate = new BufferedReader(
                    new InputStreamReader(new FileInputStream(filetemplate), "UTF-8"));

            String strLigneTexte;
            while ((strLigneTexte = brTemplate.readLine()) != null) {
                strListTemplate.add(strLigneTexte);
            }
            getGestionnaireInterface().setbTemplate(true);
            getGestionnaireInterface().setTemplate(strListTemplate);
            boolean bSauve = isbDejaSauve();
            getGestionnaireInterface().afficheTemplate();
            setbDejaSauve(bSauve);
            if (bSauve) {
                getStPrincipal().setTitle(getStPrincipal().getTitle().replace(" *", ""));
            } else {
                getStPrincipal().setTitle(getStPrincipal().getTitle().replace(" *", "") + " *");
            }
            getGestionnaireInterface().setbTemplate(false);

        } catch (FileNotFoundException ex) {
            Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }

    }

}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

/**
 *
 * @param strNomFichierBarre//from   w  w  w. j  av a  2s  .  c o  m
 */
public static void creerEditerBarre(String strNomFichierBarre) {
    apCreationBarre.getChildren().clear();
    apCreationBarre.setStyle("-fx-background-color : -fx-base;" + "-fx-border-color: derive(-fx-base,10%);"
            + "-fx-effect: dropshadow( three-pass-box , rgba(0,0,0,0.5) , 8, 0.0 , 0 , 8 );"
            + "-fx-border-width: 1px;");

    AnchorPane apOutilsBarre = new AnchorPane();
    Button btnAnnulerBarre = new Button(rbLocalisation.getString("main.quitter"),
            new ImageView(new Image("file:" + getStrRepertAppli() + "/images/annule.png")));
    final Button btnSauverBarre = new Button(rbLocalisation.getString("main.sauver"), new ImageView(
            new Image("file:" + getStrRepertAppli() + "/images/sauveProjet.png", 24, 24, true, true, true)));
    Rectangle2D tailleEcran = Screen.getPrimary().getBounds();
    btnAjouteZone = new Button(rbLocalisation.getString("main.ajouteZone"), new ImageView(
            new Image("file:" + getStrRepertAppli() + "/images/btn+.png", 24, 24, true, true, true)));
    apImgBarrePersonnalisee = new AnchorPane();
    apImgBarrePersonnalisee.getChildren().clear();
    apZoneBarrePersonnalisee = new AnchorPane();
    apZoneBarrePersonnalisee.getChildren().clear();
    apZoneBarrePersonnalisee.setLayoutX(0);
    apZoneBarrePersonnalisee.setLayoutY(150);
    apZoneBarrePersonnalisee.setPrefWidth(300);
    apZoneBarrePersonnalisee.setPrefHeight(200);

    int iLargeurEcran = (int) tailleEcran.getWidth();
    int iHauteurEcran = (int) tailleEcran.getHeight() - 100;
    final int iLargeur = 1200;
    final int iHauteur = 600;
    mbarPrincipal.setDisable(true);
    bbarPrincipal.setDisable(true);
    hbBarreBouton.setDisable(true);
    tpEnvironnement.setDisable(true);
    apCreationBarre.setPrefWidth(iLargeur);
    apCreationBarre.setMinWidth(iLargeur);
    apCreationBarre.setMaxWidth(iLargeur);
    apCreationBarre.setPrefHeight(iHauteur);
    apCreationBarre.setMinHeight(iHauteur);
    apCreationBarre.setMaxHeight(iHauteur);
    apCreationBarre.setLayoutX((iLargeurEcran - iLargeur) / 2);
    apCreationBarre.setLayoutY((iHauteurEcran - iHauteur) / 2);
    apCreationBarre.setVisible(true);
    Label lblBarrePersonnalisee = new Label(rbLocalisation.getString("main.creeBarrePersonnalisee"));
    lblBarrePersonnalisee.setMinWidth(iLargeur - 10);
    lblBarrePersonnalisee.setAlignment(Pos.CENTER);
    lblBarrePersonnalisee.setStyle("-fx-background-color : #777;");
    lblBarrePersonnalisee.setTextFill(Color.WHITE);
    lblBarrePersonnalisee.setLayoutX(5);
    lblBarrePersonnalisee.setLayoutY(10);
    lblBarrePersonnalisee.setFont(Font.font(14));
    apCreationBarre.getChildren().add(lblBarrePersonnalisee);
    apOutilsBarre.setPrefWidth(300);
    apOutilsBarre.setMinWidth(300);
    apOutilsBarre.setMaxWidth(300);
    apOutilsBarre.setPrefHeight(iHauteur - 50);
    apOutilsBarre.setMinHeight(iHauteur - 50);
    apOutilsBarre.setMaxHeight(iHauteur - 50);
    apOutilsBarre.setLayoutX(iLargeur - 302);
    apOutilsBarre.setLayoutY(50);

    apOutilsBarre.setStyle(
            "-fx-background-color : -fx-background;-fx-border-width : 1px;-fx-border-color : transparent transparent transparent -fx-outer-border;");
    btnAnnulerBarre.setPrefWidth(120);
    btnAnnulerBarre.setLayoutX(30);
    btnAnnulerBarre.setLayoutY(iHauteur - 90);
    btnSauverBarre.setPrefWidth(120);
    btnSauverBarre.setLayoutX(160);
    btnSauverBarre.setLayoutY(iHauteur - 90);
    btnSauverBarre.setDisable(true);
    Label lblChargeImage = new Label(rbLocalisation.getString("main.chargeImage"));
    lblChargeImage.setLayoutX(20);
    lblChargeImage.setLayoutY(10);
    TextField tfChargeImage = new TextField("");
    tfChargeImage.setDisable(true);
    tfChargeImage.setPrefWidth(200);
    tfChargeImage.setLayoutX(50);
    tfChargeImage.setLayoutY(40);
    Button btnChargeImage = new Button("...");
    btnChargeImage.setLayoutX(260);
    btnChargeImage.setLayoutY(40);
    final CheckBox cbMasqueZones = new CheckBox(rbLocalisation.getString("main.masqueZones"));
    cbMasqueZones.setDisable(true);
    cbMasqueZones.setLayoutX(20);
    cbMasqueZones.setLayoutY(70);
    btnAjouteZone.setLayoutX(130);
    btnAjouteZone.setLayoutY(110);
    btnAjouteZone.setDisable(true);
    apOutilsBarre.getChildren().addAll(lblChargeImage, tfChargeImage, btnChargeImage, cbMasqueZones,
            btnAjouteZone, apZoneBarrePersonnalisee, btnAnnulerBarre, btnSauverBarre);

    apCreationBarre.getChildren().addAll(apImgBarrePersonnalisee, apOutilsBarre);
    if (!strNomFichierBarre.equals("")) {
        lblChargeImage.setVisible(false);
        tfChargeImage.setVisible(false);
        btnChargeImage.setVisible(false);
        String strNomFichier = strNomFichierBarre;
        strNomFichier = strNomFichier.substring(0, strNomFichier.length() - 4);
        strNomFichierShp = strNomFichier + ".shp";
        String strNomFichierPng = strNomFichier + ".png";
        File fichPng = new File(strNomFichierPng);
        if (fichPng.exists()) {
            try {
                btnAjouteZone.setDisable(false);
                imgBarrePersonnalisee = new Image("file:" + fichPng);
                iNombreZones = getGestionnaireInterface().lisFichierShp(strNomFichierShp, zones);
                btnSauverBarre.setDisable(false);
                if (iNombreZones > 0) {
                    cbMasqueZones.setDisable(false);
                }
                afficheBarrePersonnalisee(iLargeur, iHauteur, false);

            } catch (IOException ex) {
                Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
            }

        }
    }

    btnAnnulerBarre.setOnMouseClicked((t) -> {
        mbarPrincipal.setDisable(false);
        bbarPrincipal.setDisable(false);
        hbBarreBouton.setDisable(false);
        tpEnvironnement.setDisable(false);
        apCreationBarre.setVisible(false);
    });

    btnAjouteZone.setOnMouseClicked((t) -> {
        btnAjouteZone.setDisable(true);
        ajouterZone(iLargeur, iHauteur, false);
    });
    btnChargeImage.setOnMouseClicked((t) -> {
        strRepertBarrePersonnalisee = getStrRepertAppli() + "/theme/telecommandes";
        File fileRepert;
        fileRepert = new File(strRepertBarrePersonnalisee);
        FileChooser fileChooser = new FileChooser();
        FileChooser.ExtensionFilter efShpFilter = new FileChooser.ExtensionFilter(
                "Fichiers barre personnalise (SHP)", "*.shp", "*.png");

        fileChooser.setInitialDirectory(fileRepert);
        fileChooser.getExtensionFilters().addAll(efShpFilter);

        File fileFichierImage = fileChooser.showOpenDialog(null);
        if (fileFichierImage != null) {
            String strNomFichier = fileFichierImage.getAbsolutePath();
            strNomFichier = strNomFichier.substring(0, strNomFichier.length() - 4);
            strNomFichierShp = strNomFichier + ".shp";
            String strNomFichierPng = strNomFichier + ".png";
            File fileFichierPng = new File(strNomFichierPng);
            if (fileFichierPng.exists()) {
                try {
                    btnAjouteZone.setDisable(false);
                    imgBarrePersonnalisee = new Image("file:" + fileFichierPng);
                    iNombreZones = getGestionnaireInterface().lisFichierShp(strNomFichierShp, zones);
                    btnSauverBarre.setDisable(false);
                    if (iNombreZones > 0) {
                        cbMasqueZones.setDisable(false);
                    }
                    afficheBarrePersonnalisee(iLargeur, iHauteur, false);

                } catch (IOException ex) {
                    Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
                }
            }
        }
    });

    btnSauverBarre.setOnMouseClicked((t) -> {
        try {
            sauverBarre(strNomFichierShp);
            getGestionnaireInterface().chargeBarrePersonnalisee(strNomFichierBarre);

        } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
    });
    cbMasqueZones.selectedProperty()
            .addListener((ObservableValue<? extends Boolean> ov, Boolean old_val, Boolean new_val) -> {
                afficheBarrePersonnalisee(iLargeur, iHauteur, new_val);
            });

}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

/**
 *
 * @throws IOException Exception d'entre sortie
 * @throws InterruptedException Exception interruption
 *///from w  w  w.  j  av  a2 s  . co  m
private static void projetCharge() throws IOException, InterruptedException {
    if (!bRepertSauveChoisi) {
        setStrRepertoireProjet(getStrCurrentDir());
    }
    ButtonType reponse = null;
    ButtonType buttonTypeOui = new ButtonType(rbLocalisation.getString("main.oui"));
    ButtonType buttonTypeNon = new ButtonType(rbLocalisation.getString("main.non"));
    ButtonType buttonTypeAnnule = new ButtonType(rbLocalisation.getString("main.annuler"));
    if (!isbDejaSauve()) {
        Alert alert = new Alert(AlertType.CONFIRMATION);
        alert.setHeaderText(null);
        alert.setTitle(rbLocalisation.getString("main.dialog.chargeProjet"));
        alert.setContentText(rbLocalisation.getString("main.dialog.chargeProjetMessage"));
        alert.getButtonTypes().clear();
        alert.getButtonTypes().setAll(buttonTypeOui, buttonTypeNon, buttonTypeAnnule);
        Optional<ButtonType> actReponse = alert.showAndWait();
        reponse = actReponse.get();
    }
    if (reponse == buttonTypeOui) {
        try {
            projetSauve();

        } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
    }
    if ((reponse == buttonTypeOui) || (reponse == buttonTypeNon) || (reponse == null)) {
        panePanoramique.getChildren().clear();
        panePanoramique.getChildren().add(ivImagePanoramique);
        getApAttends().setVisible(true);
        mbarPrincipal.setDisable(true);
        bbarPrincipal.setDisable(true);
        hbBarreBouton.setDisable(true);
        tpEnvironnement.setDisable(true);
        setbDejaSauve(true);
        FileChooser fcRepertChoix = new FileChooser();
        FileChooser.ExtensionFilter extFilter = new FileChooser.ExtensionFilter("fichier panoVisu (*.pvu)",
                "*.pvu");
        fcRepertChoix.getExtensionFilters().add(extFilter);
        File fileRepert = new File(getStrRepertoireProjet() + File.separator);
        fcRepertChoix.setInitialDirectory(fileRepert);
        fileProjet = null;
        fileProjet = fcRepertChoix.showOpenDialog(getStPrincipal());
        if (fileProjet != null) {
            getStPrincipal().setTitle(
                    "Panovisu v" + strNumVersion.split("-")[0] + " : " + fileProjet.getAbsolutePath());
            lblDragDrop.setVisible(false);
            setStrRepertoireProjet(fileProjet.getParent());
            ajouteFichierHisto(fileProjet.getAbsolutePath());
            bRepertSauveChoisi = true;
            deleteDirectory(getStrRepertTemp());
            String strRepertPanovisu = getStrRepertTemp() + File.separator + "panovisu";
            File fileRptPanovisu = new File(strRepertPanovisu);
            fileRptPanovisu.mkdirs();
            copieRepertoire(getStrRepertAppli() + File.separator + "panovisu", strRepertPanovisu);
            mnuPanoramique.setDisable(false);
            btnMnuPanoramique.setDisable(false);
            ivAjouterPano.setDisable(false);
            ivAjouterPano.setOpacity(1.0);
            ivSauveProjet.setDisable(false);
            ivSauveProjet.setOpacity(1.0);
            ivVisiteGenere.setDisable(false);
            ivVisiteGenere.setOpacity(1.0);

            getVbChoixPanoramique().setVisible(false);

            mniSauveProjet.setDisable(false);
            mniSauveSousProjet.setDisable(false);
            mniVisiteGenere.setDisable(false);
            setiNumPoints(0);
            setiNumImages(0);
            setiNombreDiapo(0);
            diaporamas = new Diaporama[100];
            setiNumHTML(0);
            ivImagePanoramique.setImage(null);
            cbListeChoixPanoramique.getItems().clear();
            try {
                String strTexte;
                try (BufferedReader brFichierPVU = new BufferedReader(
                        new InputStreamReader(new FileInputStream(fileProjet), "UTF-8"))) {
                    strTexte = "";
                    String strLigneTexte;
                    setiNombrePanoramiquesFichier(0);
                    while ((strLigneTexte = brFichierPVU.readLine()) != null) {
                        if (strLigneTexte.contains("Panoramique=>")) {
                            setiNombrePanoramiquesFichier(getiNombrePanoramiquesFichier() + 1);
                        }
                        strTexte += strLigneTexte + "\n";
                    }
                }
                Task taskAnalysePVU;
                taskAnalysePVU = tskAnalyseFichierPVU(strTexte);
                Thread thrAnalysePVU = new Thread(taskAnalysePVU);
                thrAnalysePVU.setDaemon(true);
                thrAnalysePVU.start();

            } catch (FileNotFoundException ex) {
                Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
            }

        }
    }
}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

/**
 *
 * @param i// w  ww .ja  va 2  s.co  m
 * @param longitude
 * @param latitude
 */
private static void afficheHSImage(int i, double longitude, double latitude) {
    double largeur = ivImagePanoramique.getFitWidth();
    double X = (longitude + 180.0d) * largeur / 360.0d + ivImagePanoramique.getLayoutX();
    double Y = (90.0d - latitude) * largeur / 360.0d;
    Circle circPoint = new Circle(X, Y, 5);
    circPoint.setFill(Color.BLUE);
    circPoint.setStroke(Color.YELLOW);
    circPoint.setId("img" + i);
    circPoint.setCursor(Cursor.DEFAULT);
    panePanoramique.getChildren().add(circPoint);
    Tooltip tltpHSImage = new Tooltip("image #" + (i + 1));
    tltpHSImage.setStyle(getStrTooltipStyle());
    Tooltip.install(circPoint, tltpHSImage);
    circPoint.setOnDragDetected((mouseEvent1) -> {
        circPoint.setFill(Color.YELLOW);
        circPoint.setStroke(Color.BLUE);
        bDragDrop = true;
        mouseEvent1.consume();

    });
    circPoint.setOnMouseDragged((mouseEvent1) -> {
        double XX = mouseEvent1.getX() - ivImagePanoramique.getLayoutX();
        if (XX < 0) {
            XX = 0;
        }
        if (XX > ivImagePanoramique.getFitWidth()) {
            XX = ivImagePanoramique.getFitWidth();
        }
        circPoint.setCenterX(XX + ivImagePanoramique.getLayoutX());
        double YY = mouseEvent1.getY();
        if (YY < 0) {
            YY = 0;
        }
        if (YY > ivImagePanoramique.getFitHeight()) {
            YY = ivImagePanoramique.getFitHeight();
        }
        circPoint.setCenterY(YY);
        afficheLoupe(XX, YY);
        mouseEvent1.consume();

    });
    circPoint.setOnMouseReleased((mouseEvent1) -> {
        String strPoint = circPoint.getId();
        strPoint = strPoint.substring(3, strPoint.length());
        int iNumeroPoint = Integer.parseInt(strPoint);
        double X1 = mouseEvent1.getSceneX();
        double Y1 = mouseEvent1.getSceneY();
        double mouseX = X1 - ivImagePanoramique.getLayoutX();
        if (mouseX < 0) {
            mouseX = 0;
        }
        if (mouseX > ivImagePanoramique.getFitWidth()) {
            mouseX = ivImagePanoramique.getFitWidth();
        }
        double mouseY = Y1 - panePanoramique.getLayoutY() - 130 - getiDecalageMac();
        if (mouseY < 0) {
            mouseY = 0;
        }
        if (mouseY > ivImagePanoramique.getFitHeight()) {
            mouseY = ivImagePanoramique.getFitHeight();
        }

        double longit, lat;
        double larg = ivImagePanoramique.getFitWidth();
        String strLong, strLat;
        longit = 360.0f * mouseX / larg - 180;
        lat = 90.0d - 2.0f * mouseY / larg * 180.0f;
        getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].getHotspotImage(iNumeroPoint).setLatitude(lat);
        getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].getHotspotImage(iNumeroPoint).setLongitude(longit);
        circPoint.setFill(Color.BLUE);
        circPoint.setStroke(Color.YELLOW);
        mouseEvent1.consume();

    });

    circPoint.setOnMouseClicked((mouseEvent1) -> {
        String strPoint = circPoint.getId();
        strPoint = strPoint.substring(3, strPoint.length());
        int iNum = Integer.parseInt(strPoint);
        Node nodePointImage;
        nodePointImage = (Node) panePanoramique.lookup("#img" + strPoint);

        if (mouseEvent1.isControlDown()) {
            valideHS();
            setbDejaSauve(false);
            getStPrincipal().setTitle(getStPrincipal().getTitle().replace(" *", "") + " *");
            panePanoramique.getChildren().remove(nodePointImage);

            for (int io = iNum + 1; io < getiNumImages(); io++) {
                nodePointImage = (Node) panePanoramique.lookup("#img" + Integer.toString(io));
                nodePointImage.setId("img" + Integer.toString(io - 1));
            }
            /**
             * on retire les anciennes indication de HS
             */
            retireAffichageHotSpots();
            setiNumImages(getiNumImages() - 1);
            getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].removeHotspotImage(iNum);
            /**
             * On les cre les nouvelles
             */
            ajouteAffichageHotspots();
            mouseEvent1.consume();
        } else {
            if (!bDragDrop) {
                File fileRepert;
                if (getStrRepertHSImages().equals("")) {
                    fileRepert = new File(getStrCurrentDir() + File.separator);
                } else {
                    fileRepert = new File(getStrRepertHSImages());
                }
                FileChooser fileChooser = new FileChooser();
                FileChooser.ExtensionFilter extFilterImages = new FileChooser.ExtensionFilter(
                        "Fichiers Images (jpg, bmp, png)", "*.jpg", "*.bmp", "*.png");

                fileChooser.setInitialDirectory(fileRepert);
                fileChooser.getExtensionFilters().addAll(extFilterImages);

                File fileFichierImage = fileChooser.showOpenDialog(null);
                if (fileFichierImage != null) {
                    setStrRepertHSImages(fileFichierImage.getParent());
                    HotspotImage HS = getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].getHotspotImage(iNum);
                    HS.setStrUrlImage(fileFichierImage.getAbsolutePath());
                    HS.setStrLienImg(fileFichierImage.getName());
                    HS.setStrInfo(fileFichierImage.getName().split("\\.")[0]);
                    File fileRepertImage = new File(getStrRepertTemp() + File.separator + "images");
                    if (!fileRepertImage.exists()) {
                        fileRepertImage.mkdirs();
                    }
                    try {
                        copieFichierRepertoire(fileFichierImage.getAbsolutePath(),
                                fileRepertImage.getAbsolutePath());

                    } catch (IOException ex) {
                        Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
                    }
                    getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].setHotspotImage(HS, iNum);
                    retireAffichageHotSpots();
                    Pane affHS1 = paneAffichageHS(strListePano(), getiPanoActuel());
                    affHS1.setId("labels");
                    vbVisuHotspots.getChildren().add(affHS1);
                }
            } else {
                bDragDrop = false;
            }
            mouseEvent1.consume();
        }

    });
}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

/**
 *
 * @param X/*from  w  w  w.  j  av a  2 s  . c  om*/
 * @param Y
 */
private static void panoAjouteImage(double X, double Y) {
    if (X > 0 && X < ivImagePanoramique.getFitWidth()) {
        valideHS();
        setbDejaSauve(false);
        getStPrincipal().setTitle(getStPrincipal().getTitle().replace(" *", "") + " *");

        double mouseX = X;
        double mouseY = Y - panePanoramique.getLayoutY() - 130 - getiDecalageMac();
        double longitude, latitude;
        double largeur = ivImagePanoramique.getFitWidth();
        longitude = 360.0f * mouseX / largeur - 180;
        latitude = 90.0d - 2.0f * mouseY / largeur * 180.0f;
        Circle circPoint = new Circle(mouseX + ivImagePanoramique.getLayoutX(), mouseY, 5);
        circPoint.setFill(Color.BLUE);
        circPoint.setStroke(Color.YELLOW);
        circPoint.setId("img" + getiNumImages());
        circPoint.setCursor(Cursor.DEFAULT);
        panePanoramique.getChildren().add(circPoint);
        Tooltip tltpImage = new Tooltip("image n " + (getiNumImages() + 1));
        tltpImage.setStyle(getStrTooltipStyle());
        Tooltip.install(circPoint, tltpImage);
        File fileRepert;
        if (getStrRepertHSImages().equals("")) {
            fileRepert = new File(getStrCurrentDir() + File.separator);
        } else {
            fileRepert = new File(getStrRepertHSImages());
        }
        FileChooser fileChooser = new FileChooser();
        FileChooser.ExtensionFilter extFilterImages = new FileChooser.ExtensionFilter(
                "Fichiers Images (jpg, bmp, png)", "*.jpg", "*.bmp", "*.png");

        fileChooser.setInitialDirectory(fileRepert);
        fileChooser.getExtensionFilters().addAll(extFilterImages);

        File fileFichierImage = fileChooser.showOpenDialog(null);
        if (fileFichierImage != null) {
            setStrRepertHSImages(fileFichierImage.getParent());
            setiNumImages(getiNumImages() + 1);
            HotspotImage HS = new HotspotImage();
            HS.setLongitude(longitude);
            HS.setLatitude(latitude);
            HS.setStrUrlImage(fileFichierImage.getAbsolutePath());
            HS.setStrLienImg(fileFichierImage.getName());
            HS.setStrInfo(fileFichierImage.getName().split("\\.")[0]);
            File fileRepertImage = new File(getStrRepertTemp() + File.separator + "images");
            if (!fileRepertImage.exists()) {
                fileRepertImage.mkdirs();
            }
            try {
                copieFichierRepertoire(fileFichierImage.getAbsolutePath(), fileRepertImage.getAbsolutePath());

            } catch (IOException ex) {
                Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
            }
            getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].addHotspotImage(HS);
            retireAffichageHotSpots();
            dejaCharge = false;
            Pane affHS1 = paneAffichageHS(strListePano(), getiPanoActuel());
            affHS1.setId("labels");
            vbVisuHotspots.getChildren().add(affHS1);
            spPanneauOutils.setVvalue(spPanneauOutils.getVvalue() + 300);

        } else {
            String strPoint = circPoint.getId();
            strPoint = strPoint.substring(3, strPoint.length());
            Node nodeImage = (Node) panePanoramique.lookup("#img" + strPoint);
            panePanoramique.getChildren().remove(nodeImage);
        }
        valideHS();
        circPoint.setOnDragDetected((mouseEvent1) -> {
            circPoint.setFill(Color.YELLOW);
            circPoint.setStroke(Color.BLUE);
            bDragDrop = true;
            mouseEvent1.consume();

        });
        circPoint.setOnMouseDragged((mouseEvent1) -> {
            double XX = mouseEvent1.getX() - ivImagePanoramique.getLayoutX();
            if (XX < 0) {
                XX = 0;
            }
            if (XX > ivImagePanoramique.getFitWidth()) {
                XX = ivImagePanoramique.getFitWidth();
            }
            circPoint.setCenterX(XX + ivImagePanoramique.getLayoutX());
            double YY = mouseEvent1.getY();
            if (YY < 0) {
                YY = 0;
            }
            if (YY > ivImagePanoramique.getFitHeight()) {
                YY = ivImagePanoramique.getFitHeight();
            }
            circPoint.setCenterY(YY);
            afficheLoupe(XX, YY);

            mouseEvent1.consume();

        });
        circPoint.setOnMouseReleased((mouseEvent1) -> {
            setbDejaSauve(false);
            getStPrincipal().setTitle(getStPrincipal().getTitle().replace(" *", "") + " *");
            String strPoint = circPoint.getId();
            strPoint = strPoint.substring(3, strPoint.length());
            int iNumeroPoint = Integer.parseInt(strPoint);
            double X1 = mouseEvent1.getSceneX();
            double Y1 = mouseEvent1.getSceneY();
            double mouseX1 = X1 - ivImagePanoramique.getLayoutX();
            if (mouseX1 < 0) {
                mouseX1 = 0;
            }
            if (mouseX1 > ivImagePanoramique.getFitWidth()) {
                mouseX1 = ivImagePanoramique.getFitWidth();
            }

            double mouseY1 = Y1 - panePanoramique.getLayoutY() - 130 - getiDecalageMac();
            if (mouseY1 < 0) {
                mouseY1 = 0;
            }
            if (mouseY1 > ivImagePanoramique.getFitHeight()) {
                mouseY1 = ivImagePanoramique.getFitHeight();
            }

            double longit, lat;
            double larg = ivImagePanoramique.getFitWidth();
            longit = 360.0f * mouseX1 / larg - 180;
            lat = 90.0d - 2.0f * mouseY1 / larg * 180.0f;
            getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].getHotspotImage(iNumeroPoint).setLatitude(lat);
            getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].getHotspotImage(iNumeroPoint).setLongitude(longit);
            circPoint.setFill(Color.BLUE);
            circPoint.setStroke(Color.YELLOW);
            mouseEvent1.consume();

        });

        circPoint.setOnMouseClicked((mouseEvent1) -> {
            String strPoint = circPoint.getId();
            strPoint = strPoint.substring(3, strPoint.length());
            int iNum = Integer.parseInt(strPoint);
            if (mouseEvent1.isControlDown()) {
                setbDejaSauve(false);
                getStPrincipal().setTitle(getStPrincipal().getTitle().replace(" *", "") + " *");
                Node nodeImage;
                nodeImage = (Node) panePanoramique.lookup("#img" + strPoint);
                panePanoramique.getChildren().remove(nodeImage);

                for (int io = iNum + 1; io < getiNumImages(); io++) {
                    nodeImage = (Node) panePanoramique.lookup("#img" + Integer.toString(io));
                    nodeImage.setId("img" + Integer.toString(io - 1));
                }
                /**
                 * on retire les anciennes indication de HS
                 */
                retireAffichageHotSpots();
                setiNumImages(getiNumImages() - 1);
                getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].removeHotspotImage(iNum);
                /**
                 * On les cre les nouvelles
                 */
                ajouteAffichageHotspots();
            } else {
                if (!bDragDrop) {
                    setbDejaSauve(false);
                    getStPrincipal().setTitle(getStPrincipal().getTitle().replace(" *", "") + " *");
                    File fileRepert1;
                    if (getStrRepertHSImages().equals("")) {
                        fileRepert1 = new File(getStrCurrentDir() + File.separator);
                    } else {
                        fileRepert1 = new File(getStrRepertHSImages());
                    }
                    FileChooser fileChooser1 = new FileChooser();
                    FileChooser.ExtensionFilter extFilterImages1 = new FileChooser.ExtensionFilter(
                            "Fichiers Images (jpg, bmp, png)", "*.jpg", "*.bmp", "*.png");

                    fileChooser1.setInitialDirectory(fileRepert1);
                    fileChooser1.getExtensionFilters().addAll(extFilterImages1);

                    File fileFichierImage1 = fileChooser1.showOpenDialog(null);
                    if (fileFichierImage1 != null) {
                        setStrRepertHSImages(fileFichierImage1.getParent());
                        HotspotImage HS = getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].getHotspotImage(iNum);
                        HS.setStrUrlImage(fileFichierImage1.getAbsolutePath());
                        HS.setStrLienImg(fileFichierImage1.getName());
                        HS.setStrInfo(fileFichierImage1.getName().split("\\.")[0]);
                        File fileRepertImage = new File(getStrRepertTemp() + File.separator + "images");
                        if (!fileRepertImage.exists()) {
                            fileRepertImage.mkdirs();
                        }
                        try {
                            copieFichierRepertoire(fileFichierImage1.getAbsolutePath(),
                                    fileRepertImage.getAbsolutePath());

                        } catch (IOException ex) {
                            Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
                        }
                        getPanoramiquesProjet()[getiPanoActuel()].setHotspotImage(HS, iNum);
                        retireAffichageHotSpots();
                        dejaCharge = false;
                        Pane affHS1 = paneAffichageHS(strListePano(), getiPanoActuel());
                        affHS1.setId("labels");
                        vbVisuHotspots.getChildren().add(affHS1);
                    }
                } else {
                    bDragDrop = false;
                }
            }
            valideHS();
            mouseEvent1.consume();
        });

    }
}

From source file:org.simmi.GeneSetHead.java

License:asdf

private void importStuff() throws IOException, UnavailableServiceException {
    boolean fail = true;
    /*try {/*  ww  w.java  2  s.com*/
       FileOpenService fos = (FileOpenService)ServiceManager.lookup("javax.jnlp.FileOpenService");
       FileContents fc = fos.openFileDialog(null, null);
       is = fc.getInputStream();
    } catch( Exception e ) {
       fail = true;
    }*/

    Path zipp = null;
    if (fail && zipp == null) {
        FileChooser fc = new FileChooser();
        File f = fc.showOpenDialog(app.getOwner());
        if (f != null)
            zipp = f.toPath();
    }

    //if( is != null ) {
    /*ByteArrayOutputStream baos = new ByteArrayOutputStream();
    byte[] bab = new byte[1024];
    int rd = is.read( bab );
    while( rd > 0 ) {
       baos.write(bab, 0, rd);
       rd = is.read( bab );
    }
    baos.close();
    zipf = baos.toByteArray();*/

    /*ZipInputStream zipm = new ZipInputStream( new ByteArrayInputStream( zipf ) );
    ZipEntry ze = zipm.getNextEntry();
    while( ze != null ) {
       String zname = ze.getName();
       if( zname.equals("unresolved.blastout") ) {
    unresolvedmap = loadunresolvedmap( new InputStreamReader( zipm ) );
       } else if( zname.equals("namemap.txt") ) {
    namemap = loadnamemap( new InputStreamReader( zipm ) );
       } else if( ze.getName().equals("designations.txt") ) {
    designations = loadDesignations( new InputStreamReader(zipm), deset );
       } else if( ze.getName().equals("plasmids.txt") ) {
    plasmids = loadPlasmids( new InputStreamReader(zipm) );
       }
       ze = zipm.getNextEntry();
    }
    if( designations == null ) designations = new TreeMap<String,String>();
    //List<Set<String>> uclusterlist = null;*/

    if (zipp != null) {
        geneset.loadStuff(zipp);

        //syncolorcomb = new JComboBox();
        syncolorcomb.getItems().clear();
        syncolorcomb.getItems().add("");
        for (String spec : geneset.speccontigMap.keySet()) {
            syncolorcomb.getItems().add(spec);
        }
        syncolorcomb.getItems().add("All");

        /*
         * is = GeneSet.class.getResourceAsStream(""); Map<String,String> komap
         * = koMapping( new FileReader("/home/sigmar/asgard-bio/data/ko"),
         * funclist, genelist ); for( Function f : funclist ) { if(
         * komap.containsKey( f.ec ) ) { for( String gn : f.geneentries ) { Gene
         * g = refmap.get(gn); if( g.keggid == null ) g.keggid =
         * komap.get(f.ec); } } }
         */

        geneset.updateShareNum(geneset.specList);

        Set<String> allecs = new HashSet<>();
        for (Function f : geneset.funclist) {
            if (f.getEc() != null)
                allecs.add(f.getEc());
        }

        for (String val : geneset.pathwaymap.keySet()) {
            Set<String> set = geneset.pathwaymap.get(val);
            for (String s : set) {
                if (allecs.contains(s)) {
                    combo.getItems().add(val);
                    break;
                }
            }
        }

        Set<String> set = new TreeSet<>();
        for (Gene g : geneset.genelist) {
            Tegeval tv = g.tegeval;
            if (tv.eval <= 0.00001 && tv.teg != null && tv.teg.startsWith("[") && tv.teg.endsWith("]"))
                set.add(tv.teg);
        }

        for (String sp : set) {
            specombo.getItems().add(sp);
        }

        if (geneset.uclusterlist != null)
            geneset.clusterMap = Serifier.initClusterNew(geneset.uclusterlist, null, null);
        //table.tableChanged( new TableModelEvent( table.getModel() ) );
        //ftable.tableChanged( new TableModelEvent( ftable.getModel() ) );
        //table.setModel( nullmodel );
        //ftable.setModel( nullmodel );
        //table.setModel( groupModel );
        //ftable.setModel( ftablemodel );
        //ftable.setItems( geneset.f);

        for (String spec : geneset.specList) {
            TableColumn<GeneGroup, Teginfo> speccol = new TableColumn(spec);
            //speccol.getStyleClass().add("tabstyle");
            speccol.setCellFactory(cell -> {
                final TableCell<GeneGroup, Teginfo> tc = new TableCell<GeneGroup, Teginfo>() {
                    @Override
                    protected void updateItem(Teginfo item, boolean empty) {
                        super.updateItem(item, empty);

                        if (item == null || item.toString().length() == 0 || empty) {
                            setText(null);
                            setStyle("");
                            //getStyleClass().remove("tabcellstyle");
                        } else {
                            setText(item.toString());
                            cellRender(this, item, 0);
                            //getStyleClass().add("tabcellstyle");
                            /*if( (this.getTableRow() != null && getTableRow().isSelected()) || isSelected() ) {
                               //setTextFill( javafx.scene.paint.Color.WHITE );
                               setStyle("-fx-background-color: darkgreen");
                            } else {
                               //setTextFill( javafx.scene.paint.Color.BLACK );
                               setStyle("-fx-background-color: green");
                            }*/
                        }
                    }
                };
                return tc;
            });
            speccol.setCellValueFactory(cellValue -> {
                GeneGroup gg = cellValue.getValue();
                Teginfo tes = gg.getTes(spec);
                return new ReadOnlyObjectWrapper(tes);
                //return new SimpleStringProperty( tes != null ? tes.toString() : "" );
                //Teginfo ret = geneset.getGroupTes( cellValue.getValue(), spec );
                //return new ObservableValue<String>( ret.toString() );
                //return ret;
            });
            table.getColumns().add(speccol);

            TableColumn<Gene, Teg> gspeccol = new TableColumn(spec);
            gspeccol.setComparator((o1, o2) -> {
                if (o1 == null) {
                    if (o2 == null) {
                        return 0;
                    } else
                        return -1;
                } else if (o1 instanceof Tegeval) {
                    if (o2 == null || o2 instanceof Teginfo) {
                        return 1;
                    }
                } else {
                    if (o2 == null) {
                        return 1;
                    } else if (o2 instanceof Tegeval) {
                        return -1;
                    }
                }
                return o1.compareTo(o2);
            });
            gspeccol.setCellFactory(cell -> {
                final TableCell<Gene, Teg> tc = new TableCell<Gene, Teg>() {
                    @Override
                    protected void updateItem(Teg item, boolean empty) {
                        super.updateItem(item, empty);

                        if (item == null || item.toString().length() == 0 || empty) {
                            setText("");
                            setStyle("");
                        } else {
                            boolean render = cellRenderGene(this, item);
                            setText(item.toString());
                            if (!render)
                                setStyle("");
                            //getStyleClass().add("tabcellstyle");
                            /*if( (this.getTableRow() != null && getTableRow().isSelected()) || isSelected() ) {
                               //setTextFill( javafx.scene.paint.Color.WHITE );
                               setStyle("-fx-background-color: white");
                            } else {
                               //setTextFill( javafx.scene.paint.Color.BLACK );
                               setStyle("-fx-background-color: black");
                            }*/
                        }
                    }
                };
                return tc;
            });
            gspeccol.setCellValueFactory(cellValue -> {
                Gene g = cellValue.getValue();

                //Teginfo tes = g.tegeval;//getTes( spec );
                if (spec.equals(g.getSpecies())) {
                    return new ReadOnlyObjectWrapper(g.tegeval);
                } else {
                    GeneGroup gg = g.getGeneGroup();
                    Set<String> specset = gg.getSpecies();
                    if (specset.contains(spec)) {
                        Teginfo ti = gg.getGenes(spec);
                        return new ReadOnlyObjectWrapper(ti);
                    }
                }
                //return new SimpleStringProperty( tes != null ? tes.toString() : "" );
                //Teginfo ret = geneset.getGroupTes( cellValue.getValue(), spec );
                //return new ObservableValue<String>( ret.toString() );
                //return ret;
                return null;
            });

            /*gspeccol.setCellValueFactory( cellValue -> {
               return new SimpleStringProperty( cellValue.getValue().toString() );
               //Teginfo ret = geneset.getGroupTes( cellValue.getValue(), spec );
               //return new ObservableValue<String>( ret.toString() );
               //return ret;
            });*/
            gtable.getColumns().add(gspeccol);
        }

        ObservableList<Function> ofunc = FXCollections.observableList(geneset.funclist);
        ffilteredData = new FilteredList<>(ofunc, p -> true);
        fsortedData = new SortedList<>(ffilteredData);
        fsortedData.comparatorProperty().bind(ftable.comparatorProperty());
        ftable.setItems(fsortedData);

        ObservableList<GeneGroup> ogenegroup = FXCollections.observableList(geneset.allgenegroups);
        filteredData = new FilteredList<>(ogenegroup, p -> true);
        sortedData = new SortedList<>(filteredData);
        sortedData.comparatorProperty().bind(table.comparatorProperty());
        table.setItems(sortedData);

        ObservableList<Gene> ogene = FXCollections.observableList(geneset.genelist);
        gtable.setItems(ogene);

        int me = 0;
        int mu = 0;
        for (Gene g : geneset.genelist) {
            if (g.getGeneGroup() != null)
                me++;
            else
                mu++;
        }
        System.err.println(me + "  " + mu);
    }

    String userhome = System.getProperty("user.home");
    File f = new File(userhome);
    File idf = new File(f, "idspec.txt");
    BufferedWriter bw = new BufferedWriter(new FileWriter(idf)); //Files.newBufferedWriter(idf.toPath(), OpenOption.);
    for (String id : geneset.refmap.keySet()) {
        Gene g = geneset.refmap.get(id);
        bw.write(id + "\t" + g.getSpecies() + "\n");
    }
    bw.close();
}

From source file:editeurpanovisu.EditeurPanovisu.java

/**
 *
 *///w  w w . j a  va 2  s  . c  om
private static void planAjouter() {
    FileChooser fileChooser = new FileChooser();

    FileChooser.ExtensionFilter extFilterJpeg = new FileChooser.ExtensionFilter("Fichiers JPEG (*.jpg)",
            "*.jpg");
    FileChooser.ExtensionFilter extFilterBmp = new FileChooser.ExtensionFilter("Fichiers BMP (*.bmp)", "*.bmp");
    FileChooser.ExtensionFilter extFilterPng = new FileChooser.ExtensionFilter("Fichiers PNG (*.png)", "*.png");
    File repert = new File(getStrCurrentDir() + File.separator);
    fileChooser.setInitialDirectory(repert);
    fileChooser.getExtensionFilters().addAll(extFilterJpeg, extFilterPng, extFilterBmp);

    File fileFichierPlan = fileChooser.showOpenDialog(null);
    if (fileFichierPlan != null) {
        getPlans()[getiNombrePlans()] = new Plan();
        getPlans()[getiNombrePlans()].setStrImagePlan(fileFichierPlan.getName());
        getPlans()[getiNombrePlans()].setStrLienPlan(fileFichierPlan.getAbsolutePath());
        File fileRepertoirePlan = new File(getStrRepertTemp() + File.separator + "images");
        if (!fileRepertoirePlan.exists()) {
            fileRepertoirePlan.mkdirs();
        }
        try {
            copieFichierRepertoire(fileFichierPlan.getAbsolutePath(), fileRepertoirePlan.getAbsolutePath());

        } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(EditeurPanovisu.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
        getGestionnairePlan().ajouterPlan();
        setiNombrePlans(getiNombrePlans() + 1);
    }

}