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molgenis-core-1.1.0.jar file has the following types.

META-INF/MANIFEST.MF
META-INF/maven/org.molgenis/molgenis-core/pom.properties
META-INF/maven/org.molgenis/molgenis-core/pom.xml
org.molgenis.Molgenis.class
org.molgenis.MolgenisFieldTypes.class
org.molgenis.MolgenisOptions.class
org.molgenis.Version.class
org.molgenis.fieldtypes.BoolField.class
org.molgenis.fieldtypes.CategoricalField.class
org.molgenis.fieldtypes.CompoundField.class
org.molgenis.fieldtypes.DateField.class
org.molgenis.fieldtypes.DatetimeField.class
org.molgenis.fieldtypes.DecimalField.class
org.molgenis.fieldtypes.EmailField.class
org.molgenis.fieldtypes.EnumField.class
org.molgenis.fieldtypes.FieldType.class
org.molgenis.fieldtypes.FileField.class
org.molgenis.fieldtypes.HtmlField.class
org.molgenis.fieldtypes.HyperlinkField.class
org.molgenis.fieldtypes.ImageField.class
org.molgenis.fieldtypes.IntField.class
org.molgenis.fieldtypes.LongField.class
org.molgenis.fieldtypes.MrefField.class
org.molgenis.fieldtypes.StringField.class
org.molgenis.fieldtypes.TextField.class
org.molgenis.fieldtypes.XrefField.class
org.molgenis.framework.db.WebAppDatabasePopulator.class
org.molgenis.framework.db.WebAppDatabasePopulatorService.class
org.molgenis.framework.server.MolgenisSettings.class
org.molgenis.framework.ui.MolgenisPlugin.class
org.molgenis.framework.ui.MolgenisPluginController.class
org.molgenis.framework.ui.MolgenisPluginRegistry.class
org.molgenis.generators.DataTypeCommons.java.ftl
org.molgenis.generators.DataTypeGen.class
org.molgenis.generators.DataTypeGen.java.ftl
org.molgenis.generators.DataTypeTestGen.java.ftl
org.molgenis.generators.EntityMetaDataGen.class
org.molgenis.generators.EntityMetaDataGen.java.ftl
org.molgenis.generators.ForEachEntityGenerator.class
org.molgenis.generators.ForEachMatrixGenerator.class
org.molgenis.generators.Generator.class
org.molgenis.generators.GeneratorHelper.class
org.molgenis.generators.JpaRepositoryGen.class
org.molgenis.generators.JpaRepositoryGen.java.ftl
org.molgenis.generators.JpaRepositorySourceGen.class
org.molgenis.generators.JpaRepositorySourceGen.java.ftl
org.molgenis.generators.db.CrudRepositorySecurityDecoratorGen.class
org.molgenis.generators.db.CrudRepositorySecurityDecoratorGen.java.ftl
org.molgenis.generators.db.DatabaseConfigGen.class
org.molgenis.generators.db.DatabaseConfigGen.java.ftl
org.molgenis.generators.db.EntitiesImporterGen.class
org.molgenis.generators.db.EntitiesImporterGen.java.ftl
org.molgenis.generators.db.EntitiesValidatorGen.class
org.molgenis.generators.db.EntitiesValidatorGen.java.ftl
org.molgenis.generators.db.JDBCMetaDatabaseGen.class
org.molgenis.generators.db.JDBCMetaDatabaseGen.java.ftl
org.molgenis.generators.db.JpaDatabaseGen.class
org.molgenis.generators.db.JpaDatabaseGen.java.ftl
org.molgenis.generators.db.PersistenceGen.class
org.molgenis.generators.doc.DotDocGen.class
org.molgenis.generators.doc.DotDocGen.java.ftl
org.molgenis.generators.doc.DotDocMinimalGen.class
org.molgenis.generators.doc.DotDocMinimalGen.java.ftl
org.molgenis.generators.doc.DotDocModuleDependencyGen.class
org.molgenis.generators.doc.DotDocModuleDependencyGen.java.ftl
org.molgenis.generators.doc.EntityModelDocGen.class
org.molgenis.generators.doc.EntityModelDocGen.java.ftl
org.molgenis.generators.doc.FileFormatDocGen.class
org.molgenis.generators.doc.FileFormatDocGen.java.ftl
org.molgenis.generators.doc.ObjectModelDocGen.class
org.molgenis.generators.doc.ObjectModelDocGen.java.ftl
org.molgenis.generators.doc.TableDocGen.class
org.molgenis.generators.doc.TableDocGen.java.ftl
org.molgenis.generators.doc.TextUmlGen.class
org.molgenis.generators.doc.TextUmlGen.java.ftl
org.molgenis.model.DatabaseModelExtractor.class
org.molgenis.model.MolgenisModel.class
org.molgenis.model.MolgenisModelException.class
org.molgenis.model.MolgenisModelParser.class
org.molgenis.model.MolgenisModelValidator.class
org.molgenis.model.elements.DBSchema.class
org.molgenis.model.elements.Dataset.class
org.molgenis.model.elements.Entity.class
org.molgenis.model.elements.Field.class
org.molgenis.model.elements.FieldWithXrefLabel.class
org.molgenis.model.elements.Form.class
org.molgenis.model.elements.Import.class
org.molgenis.model.elements.Index.class
org.molgenis.model.elements.Matrix.class
org.molgenis.model.elements.Menu.class
org.molgenis.model.elements.Method.class
org.molgenis.model.elements.MethodQuery.class
org.molgenis.model.elements.MethodSchema.class
org.molgenis.model.elements.Model.class
org.molgenis.model.elements.Module.class
org.molgenis.model.elements.PRSchema.class
org.molgenis.model.elements.Parameter.class
org.molgenis.model.elements.Plugin.class
org.molgenis.model.elements.Processor.class
org.molgenis.model.elements.Record.class
org.molgenis.model.elements.Report.class
org.molgenis.model.elements.Tree.class
org.molgenis.model.elements.UISchema.class
org.molgenis.model.elements.Unique.class
org.molgenis.model.elements.View.class
org.molgenis.model.jaxb.Entity.class
org.molgenis.model.jaxb.Field.class
org.molgenis.model.jaxb.Menu.class
org.molgenis.model.jaxb.Model.class
org.molgenis.model.jaxb.Module.class
org.molgenis.model.jaxb.Screen.class
org.molgenis.model.jaxb.Unique.class
org.molgenis.util.ApplicationContextProvider.class
org.molgenis.util.ApplicationUtil.class
org.molgenis.util.AsyncJavaMailSender.class
org.molgenis.util.CaseInsensitiveLinkedHashMap.class
org.molgenis.util.CloseableIterator.class
org.molgenis.util.CountryCodes.class
org.molgenis.util.DateStringAdapter.class
org.molgenis.util.DetectOS.class
org.molgenis.util.EntityImportedEvent.class
org.molgenis.util.ErrorMessageResponse.class
org.molgenis.util.ExceptionHandler.class
org.molgenis.util.FileStore.class
org.molgenis.util.FileUploadUtils.class
org.molgenis.util.GsonHttpMessageConverter.class
org.molgenis.util.HandleRequestDelegationException.class
org.molgenis.util.HtmlTools.class
org.molgenis.util.InstallCert.class
org.molgenis.util.LinkableTree.class
org.molgenis.util.ListEscapeUtils.class
org.molgenis.util.MolgenisDateFormat.class
org.molgenis.util.Pair.class
org.molgenis.util.Property.class
org.molgenis.util.RScript.class
org.molgenis.util.RScriptException.class
org.molgenis.util.SchemaLoader.class
org.molgenis.util.SimpleTree.class
org.molgenis.util.Ssh.class
org.molgenis.util.SshResult.class
org.molgenis.util.TextFileUtils.class
org.molgenis.util.Tree.class
org.molgenis.util.ValueLabel.class
org.molgenis.util.ZipUtils.class
org.molgenis.util.cmdline.CmdLineException.class
org.molgenis.util.cmdline.CmdLineParser.class
org.molgenis.util.cmdline.FieldAssign.class
org.molgenis.util.cmdline.Option.class
org.molgenis.util.cmdline.OptionsClass.class
org/molgenis/generators/GeneratorHelper.ftl
org/molgenis/generators/db/PersistenceGen.xml.ftl

Pom

molgenis-core-1.1.0.pom file content.

<project xmlns="http://maven.apache.org/POM/4.0.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://maven.apache.org/POM/4.0.0 http://maven.apache.org/xsd/maven-4.0.0.xsd">
	<modelVersion>4.0.0</modelVersion>
	<parent>
	  <groupId>org.molgenis</groupId>
	  <artifactId>molgenis</artifactId>
	  <version>1.1.0</version>
	</parent>
	<artifactId>molgenis-core</artifactId>
	<packaging>jar</packaging>

    <build>
        <resources>
            <resource>
                <directory>src/main/java</directory>
                <includes>
                    <include>**/*.ftl</include>
                </includes>
            </resource>
        </resources>
    </build>
    
    <dependencies>
        <!-- database hibernate, connectionpool, driver -->
		<dependency>
			<groupId>org.eclipse.persistence</groupId>
			<artifactId>eclipselink</artifactId>
			<version>2.5.0</version>
		</dependency>
		<dependency>
		    <groupId>c3p0</groupId>
		    <artifactId>c3p0</artifactId>
		    <version>0.9.1.2</version>
		</dependency>
        <dependency>
            <groupId>org.hibernate</groupId>
            <artifactId>hibernate-validator</artifactId>
            <version>4.2.0.Final</version>
        </dependency>
        <!-- Commons Utils -->
        <dependency>
            <groupId>org.apache.commons</groupId>
            <artifactId>commons-lang3</artifactId>
            <version>3.1</version>
        </dependency>
        <dependency>
            <groupId>commons-fileupload</groupId>
            <artifactId>commons-fileupload</artifactId>
            <version>1.2</version>
        </dependency>
        <dependency>
            <groupId>commons-io</groupId>
            <artifactId>commons-io</artifactId>
            <version>2.4</version>
        </dependency>
        <!-- Freemarker -->
        <dependency>
            <groupId>org.freemarker</groupId>
            <artifactId>freemarker</artifactId>
            <version>2.3.18</version>
        </dependency>
        <!-- SSH -->
        <dependency>
            <groupId>ch.ethz.ganymed</groupId>
            <artifactId>ganymed-ssh2</artifactId>
            <version>build210</version>
        </dependency>
        <!-- findbugs annotations -->
        <dependency>
            <groupId>com.kenai.nbpwr</groupId>
            <artifactId>edu-umd-cs-findbugs-annotations</artifactId>
            <version>1.3.2-201002241900</version>
        </dependency>
        <!-- Excel -->
        <dependency>
            <groupId>org.apache.poi</groupId>
            <artifactId>poi</artifactId>
            <version>3.9</version>
        </dependency>
        <dependency>
            <groupId>org.apache.poi</groupId>
            <artifactId>poi-ooxml</artifactId>
            <version>3.9</version>
			<exclusions>
				<exclusion>
					<groupId>stax</groupId>
					<artifactId>stax-api</artifactId>
				</exclusion>
			</exclusions>
        </dependency>
        <!-- override version xml-apis 1.0b2 (poi-ooxml dependency) to prevent conflicts -->
        <dependency>
            <groupId>xml-apis</groupId>
            <artifactId>xml-apis</artifactId>
            <version>1.4.01</version>
        </dependency>
        <!-- JSON Lib -->
        <dependency>
            <groupId>com.google.code.gson</groupId>
            <artifactId>gson</artifactId>
            <version>2.2.2</version>
        </dependency>
        <dependency>
		    <groupId>com.google.guava</groupId>
		    <artifactId>guava</artifactId>
		    <version>16.0.1</version>
		</dependency>
		<dependency>
			<groupId>com.google.code.findbugs</groupId>
			<artifactId>jsr305</artifactId>
			<version>2.0.1</version>
		</dependency>
		<dependency>
			<groupId>net.sf.opencsv</groupId>
			<artifactId>opencsv</artifactId>
			<version>2.3</version>
		</dependency>
         <!-- Spring -->
         <dependency>
			<groupId>org.springframework.data</groupId>
			<artifactId>spring-data-commons</artifactId>
			<version>1.6.2.RELEASE</version>
		</dependency>
		<dependency>
			<groupId>org.springframework</groupId>
			<artifactId>spring-web</artifactId>
		</dependency>
		<dependency>
		    <groupId>org.springframework</groupId>
		    <artifactId>spring-context-support</artifactId>
		</dependency>
		<dependency>
		    <groupId>org.springframework</groupId>
		    <artifactId>spring-orm</artifactId>
		</dependency>
		<dependency>
		    <groupId>org.springframework.security</groupId>
		    <artifactId>spring-security-web</artifactId>
		    <version>${spring.security.version}</version>
		</dependency>
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		    <groupId>org.springframework.security</groupId>
		    <artifactId>spring-security-core</artifactId>
		    <version>${spring.security.version}</version>
		</dependency>
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		    <groupId>com.sun.mail</groupId>
		    <artifactId>javax.mail</artifactId>
		    <version>1.5.0</version>
		</dependency>
    </dependencies>
</project>

POM Entry

<dependency>
   <groupId>org.molgenis</groupId>
   <artifactId>molgenis-core</artifactId>
   <version>1.1.0</version>
</dependency>

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